Debajo de las encantadoras calles adoquinadas de Quesberg viven los Boxtrolls, unos seres desvergonzados que salen de las alcantarillas por la noche. Sin embargo, en realidad los Boxtrolls son una comunidad de inofensivos aunque extraños seres que habita un espacio cavernoso en el subsuelo y que llevan cajas de cartón reciclado como las tortugas su caparazón. Solo salen a la superficie de noche para recoger piezas mecánicas y chatarra que los habitantes han tirado. Los Boxtrolls han criado a un pequeño huérfano humano llamado Eggs desde su más tierna infancia. Cuando el malvado exterminador de plagas Archibald Birlante decide erradicarlos, la amable y simpática panda de chatarreros debe pedir ayuda a su hijo adoptivo y a una aventurera niña rica llamada Winnie.