Lyra Belacqua es una huérfana de 12 años que vive como una reclusa en el Jordan College, en la ciudad de Oxford. Lyra pertenece a uno de los muchos mundos paralelos: mundos no vistos, dimensiones intangibles donde la humanidad se desarrolla con sutiles diferencias. Pero Lyra nunca está sola en el suyo. Ella va a todas partes con su daimonion, un pequeño animal siempre cambiante llamado Pantalaimon. En otros mundos el alma reside dentro del cuerpo de las personas, oculta y en silencio. En el suyo, el daimonion es un compañero de por vida. Sin embargo, el mundo de Lyra está cambiando. El supremo cuerpo de Gobierno, llamado Magisterium, está apretando sus garras contra la población.