Tokio, cerca del final de la Segunda Guerra Mundial en el Pacífico. Mahito, un niño de 11 años, pierde a su madre en un incendio y se refugia con su padre en el pueblo natal de ella. Se mudan a una vieja mansión en una gran finca, que también incluye una torre aislada y que se ha convertido en lugar de anidamiento de una garza real. Mahito se debate entre sus complejos sentimientos hacia su padre, que dirige una fábrica de suministros de guerra, y su nueva madrastra, Natsuko, que resulta ser la hermana pequeña de su madre. Para empeorar las cosas, se siente alienado en la escuela.